新教神学院（原名捷克斯洛伐克新教神学院）于 1919 年 4 月 28 日在布拉格成立。第一次世界大战之前，捷克土地（当时是奥地利天主教的一部分）对新教徒有很多限制。时间），而该部的候选人不得不去维也纳学习。随着战后新捷克斯洛伐克国家的建立，实现了完全的宗教自由。
改革宗和路德宗新教徒联合成立了捷克弟兄会福音派教会，其首要行动之一是建立新教神学学院，以培训其神学学生和其他教会的神学学生。学院成立的第一年有 14 名学生，但很快在 1923 年和 1929 年分别增至 78 名和 160 名。女性于 1922 年开始在该学院学习；在 1953 年捷克弟兄会福音派教会会议决定任命女性担任该部职务后，她们的人数大幅增加。 在德国占领期间，该学院与大多数其他高等教育机构一起关闭，但在第二次世界大战结束了。 1949-50 年有 230 名学生。
1950 年，共产主义国家决定将学院分为两所学校：面向捷克斯洛伐克胡斯教会学生的胡斯神学院和面向捷克弟兄会福音派教会和较小教会学生的夸美纽斯新教神学院。在共产党统治下，夸美纽斯学院经历了许多困难，学生人数下降到 100 人以下。在 1950 年代和 1960 年代的大部分时间里，院长是主要的捷克新教神学家 Josef Lukl Hromádka。 1989 年共产党政权垮台后，康美纽斯学院迎来了新的机遇。学生人数大幅增加。 1990 年，科美纽斯学院并入查尔斯大学，并更名为新教神学院。 1995 年，它搬到了现址上更大的场所。 2007-2008 年，学院拥有约 500 名学生和约 25 名教职员工。
学院印章及其标志
思考 – 行动 – 说话：作为盐的神学
对学院会徽的一些思考
帕维尔·菲利皮
当布拉格新教神学院于 1919 年成立时，其创始人面临着一项小任务，以及许多更重要的任务：如何象征性地代表他们所建立的传统和他们的目标。因此，他们设计了一个新的标志，今天仍然用作学院的印章。
如何理解它的象征意义？
在圆形设计的中心，我们看到了一个圣杯。这清楚地象征着与捷克宗教改革遗产的联系，特别是与胡斯宗教改革的联系，后者重新引入了外行人在庆祝圣餐时接受圣杯。 1417 年，布拉格大学的整个神学院都呼吁两种形式的共融，站在革命的一边，从而冒着革命的存在风险：一年之内，康斯坦茨议会撤销了其教学许可证。在选择这个符号时，新学院表明它像胡斯派一样致力于圣杯（包括所有这些可能需要），并且拒绝任何形式的教权主义，包括神学教权主义。
在圆形设计的上半部分，我们可以读出拉丁文：SAPERE、AGERE、LOQUI，在英文中的意思是：思考、行动、说话。这个座右铭的历史渊源可以追溯到旧兄弟会的最后一位主教扬·阿莫斯·科门斯基（夸美纽斯）。这些术语的选择以及它们链接在一起的方式无需任何进一步解释即可理解。新学院想要培养的神学应该是学术性的，需要严格的知识学科；它应该是实用的，并导致采取行动；最后，它应该建立在对话的基础上，拒绝所有其他在圣经之外传播真理的方法。术语的排列顺序可能令人惊讶，“说话”排在第三位，形成了座右铭的高潮。但是，当我们想起捷克宗教改革对上帝话语自由的极大重视时，这种惊奇就消失了。自由地宣扬解放圣言本身就是“最自由的行动”（actus liberimus omnium），能够使基督教从巴比伦的囚禁中解放出来。一次又一次，即使在最严重的压迫时期，捷克新教基督徒也一次又一次地经历了这样一个事实：“上帝的话语没有被束缚”（2 Tim. 2:9），相反，它为自己创造了一个言论自由的空间.继承这一经验和传统，学院创始人致力于将学院建立为言论自由的避难所，植根于上帝话语的自由。
在标志的中央部分，在圣杯的左右两侧，是一个难题，以两次引用圣经的形式出现 - 利未记 2:13 和马可福音 9:49。在这两段经文中都可以找到“盐”（拉丁语 sal）这个词。当我们意识到格言中三个词（Sapere、Agere、Loqui）的首字母共同构成拉丁词 SAL 时，格言和圣经引文之间的联系就变得清晰起来。
但是神学和神学与盐有什么关系呢？是什么促使我们选择标志设计的前辈从圣经中提到盐的许多地方中选择了这两段？今天我们只能猜测他们心中的释经。然而，我们可以合理地肯定，他们面前的马可引文版本可能没有被原始手稿证实，但经常出现在圣经的改革宗译本中。根据这个版本，耶稣的话是：“一切祭物都要用盐腌制。”我们感到震惊的是，在这两段经文中，“盐”一词与祭祀的概念密切相关。利未记 2:13 吩咐说：“你一切的素祭都要用盐调味。不要在素祭中留下你神立约的盐。在你所有的祭品上加盐。”
神学作为牺牲的参考？学院的创始人是否想强调学院应该继续将注意力集中在基督教信息的核心——基督在十字架上的牺牲？也许。但也许他们在设计会徽时有其他想法。因为在这两个引文中，盐都被称为附加成分，它会溶解并分散在整个祭品中。而这种自我解体和自我散播，正是神学的基本功能之一。通过质疑自己的自我保护本能，它致力于为基督徒和公民社区服务，警告和保护他们免受利己主义的腐败，并鼓励他们无私地为那些愿意服务的人服务。被认为在这个世界上最不重要。通过这种方式，神学可以为确保人类家庭不会失去自我否定和自愿放弃的维度做出贡献，否则就不可能有人类尊严的生活或和平共处。